陰莖和睪丸的發(fā)育需要下丘腦-垂體-性腺軸激素的作用，下丘腦產(chǎn)生的促性腺激素釋放激素( GnRH) 刺激垂體前葉分泌促性腺激素，包括促卵泡生成素( FSH) 和黃體生成素(LH) ，與絨毛膜促性腺激素( HCG) 共同作用刺激睪丸間質(zhì)細(xì)胞分泌睪酮(T) ，下丘腦-垂體-性腺軸及雄激素合成和轉(zhuǎn)化過程中任何一個(gè)環(huán)節(jié)出現(xiàn)異常，皆會(huì)影響陰莖和睪丸的發(fā)育。其病因分類如下：

1.促性腺激素分泌不足的性腺功能減退

(1)腦組織結(jié)構(gòu)異常：

無腦畸形患兒無下丘腦分泌功能，即使腦垂體發(fā)育正常，由于無促性腺激素釋放激素，致使睪酮分泌少，造成小陰莖。先天性腦垂體不發(fā)育，部分腦胼胝體發(fā)育不良導(dǎo)致的下丘腦功能障礙，枕部腦膨出伴運(yùn)動(dòng)失調(diào)的小腦畸形等腦中線發(fā)育異常，均因促性腺激素分泌不足而引起小陰莖。此外還導(dǎo)致其他系統(tǒng)的多發(fā)畸形。

(2)先天性促性腺激素釋放激素缺乏：

此類原因引起的小陰莖比前者多見，具體病因不清，多為各種綜合征，如Kallmann、帕德維利綜合征(Prader-Willi)、Lawrence-Moon-Beidel綜合征等，常伴有多發(fā)畸形，據(jù)研究與染色體、基因異常有關(guān)。還有因內(nèi)分泌、生化代謝異常導(dǎo)致的促性腺激素釋放激素、黃體生成激素等缺乏癥。

2.促性腺激素分泌過多的性腺功能減退

這類病人的下丘腦、垂體分泌功能均正常，只是在母胎妊娠期間睪丸出現(xiàn)了退行性變而致使睪酮分泌減少，通過負(fù)反饋途徑而致促性腺激素分泌過多。引起小陰莖的原因主要在睪丸本身，如先天性睪丸缺如、睪丸下降不全等。有的病人睪丸正常，但其黃體生成激素受體異常，以至不能分泌足量睪酮。此外需注意有無性別異常。

3.原發(fā)性小陰莖

　　除上述原因外，還有少部分病人下丘腦-垂體-睪丸軸激素分泌正常，但有小陰莖畸形，到了青春期又多能增長(zhǎng)。病因不清楚，推測(cè)有可能是胚胎后期促性腺激素刺激延遲、一過性睪酮分泌下降等原因。也有少部分患者可能為雄激素受體異常。

　　小陰莖病人可有性染色體異常，如Klinefelter綜合征(47，XXY)、多綜合征(48，XXXY及49，XXXXY)、多染色體(69，XXY三倍體)畸形。

二、發(fā)病機(jī)制

正常男性的陰莖發(fā)育一般在胚胎期的前12周完成，分3個(gè)階段。

第1階段為生殖結(jié)節(jié)期：

生殖結(jié)節(jié)逐漸延長(zhǎng)類似小丘，長(zhǎng)8～15mm。

第2階段為陰莖體期：

在雙氫睪酮(dihydrotestosterone，DHT)的作用下陰莖繼續(xù)增長(zhǎng)呈圓柱狀，長(zhǎng)約16～38mm，尿道溝延伸至陰莖頭。

第3階段：

陰莖長(zhǎng)度為38～45mm，尿道發(fā)育完成。

胚胎發(fā)育到第7～8周生殖腺逐步分化成睪丸，并在胎盤產(chǎn)生的絨毛膜促性腺激素(HCG)的刺激下，睪丸間質(zhì)細(xì)胞(Leydig’s細(xì)胞)產(chǎn)生睪酮。妊娠4個(gè)月后胎兒下丘腦分泌促性腺激素釋放激素(gonadotropin-nelasing hormone，GRH)，刺激垂體前葉產(chǎn)生黃體激素(LH)及尿促性素(FSH)。在HCG、LH及FSH共同作用下，睪丸不斷產(chǎn)生睪酮，睪酮又在5-α還原酶的作用下轉(zhuǎn)化成DHT刺激陰莖逐漸增長(zhǎng)。

小陰莖多因胚胎14周后激素缺乏所致。